新京報(bào)訊 據(jù)中國(guó)農(nóng)業(yè)科學(xué)院網(wǎng)站消息,近日,中國(guó)農(nóng)業(yè)科學(xué)院生物技術(shù)研究所聯(lián)合多家單位,繪制出大豆全景定量蛋白質(zhì)組圖譜,揭示了RNA甲基化在調(diào)控大豆蛋白表達(dá)量中的作用,并利用蛋白質(zhì)組數(shù)據(jù)挖掘出調(diào)控大豆發(fā)育的新表觀因子MTBa。相關(guān)研究成果發(fā)表在《細(xì)胞·基因組學(xué)(Cell Genomics)》上。
大豆基因組數(shù)據(jù)盡管可以提供大量信息,但不足以闡明具體生物學(xué)功能,蛋白質(zhì)是生物過(guò)程的主要執(zhí)行者,蛋白質(zhì)組研究在揭示植物表型背后的分子機(jī)制中扮演著不可替代的角色,因此獲取高質(zhì)量的大豆定量蛋白質(zhì)組數(shù)據(jù)對(duì)研究大豆蛋白質(zhì)表達(dá)調(diào)控機(jī)制具有重要意義。
該科研團(tuán)隊(duì)對(duì)大豆14個(gè)器官中超過(guò)12800個(gè)基因的蛋白質(zhì)水平進(jìn)行了量化分析,并同時(shí)完成了同批14個(gè)器官的轉(zhuǎn)錄組水平鑒定及N6-腺苷酸甲基化(m6A)修飾的定量圖譜繪制。對(duì)圖譜數(shù)據(jù)的分析發(fā)現(xiàn),蛋白質(zhì)在不同組織間的相關(guān)性高于轉(zhuǎn)錄本,大量基因在轉(zhuǎn)錄與蛋白層面并未呈現(xiàn)顯著關(guān)聯(lián),蛋白質(zhì)與轉(zhuǎn)錄本豐度在不同器官間存在顯著差異。研究還闡明了m6A修飾在大豆中的全局分布及分子功能,鑒定出調(diào)控大豆發(fā)育的關(guān)鍵m6A調(diào)控因子MTBa,表明蛋白質(zhì)組數(shù)據(jù)能有效助力大豆新基因的發(fā)現(xiàn)。
在后基因組時(shí)代,該研究將大豆研究焦點(diǎn)從基因和轉(zhuǎn)錄層面,轉(zhuǎn)向蛋白質(zhì)組層面,并通過(guò)探討表觀因子在轉(zhuǎn)錄后階段的調(diào)控作用,揭示了蛋白質(zhì)表達(dá)量同時(shí)受轉(zhuǎn)錄與轉(zhuǎn)錄后修飾共同影響的機(jī)制,為依據(jù)多組學(xué)數(shù)據(jù)的大豆智能設(shè)計(jì)育種開(kāi)辟了新思路。
編輯 張樹(shù)婧